始新世‒渐新世气候转折期（EOT）全球气候与植被变化研究进展

最后，建议未来研究应重点推动大数据与数值模拟的深度融合，构建高精度时空框架，并发展更可靠的气候与植被模型，以提升对EOT气候‒植被协同演变机制的理解。该研究为预测未来气候变化下陆地生态系统的响应提供了深时类比。通过整合多源数据与模型，有望揭示气候‒生物圈相互作用的复杂性，为全球变化研究提供理论支撑。

唇形科香薷族的分类学研究取得新进展

基于多基因联合分析的结果确认了香薷族的单系性，并将其划分为五个主要支系，同时确认香简草属、香薷属及紫苏属均非单系类群。基于分子数据、形态特征和地理分布证据，研究团队提出了全新的属级分类方案：建议扩大紫苏属的界定范围，将香简草属和石荠苎属并入其中；同时从香薷属中拆分出密花香薷属，恢复其合法属名Paulseniella Briq.，用于容纳传统上归属于香薷属的三个物种。经过重新界定的香薷属成为一个单系群，并可进一步划分为五个亚分支。

全球热带森林树种多样性维持遵循“通用法则”

研究结果揭示了明确的环境因子驱动模式：水分可用性是影响树种α多样性的最主要因素，而土壤特性在局域尺度上起着同样显著调节作用。进一步分析表明，这些环境因子存在“共同限制”效应，即热带树种多样性受制于多个环境维度的协同作用，而非单一因子的独立控制。这也解释了为何在如亚马逊流域等水热与土壤条件俱佳的区域，会形成全球树种多样性极高的森林群落。

微生物生活史策略的权衡驱动了喀斯特植被恢复中的土壤碳循环过程

结果表明：1）植被恢复显著提高了土壤有机碳及惰性有机碳含量，同时降低了溶解性无机氮含量和活性有机碳组分的比例；2）植被恢复过程中，土壤微环境的改变导致了碳循环微生物多样性有所下降，但提高了微生物共生网络的复杂性与稳定性，微生物群落的生活史策略也由以r对策为主逐渐转向以K对策为主；3）与恢复初期相比，后期微生物群落在碳养分获取方式上发生了明显的转变，具体表现为参与碳固定和活性碳化合物降解的功能基因表达显著降低，而参与惰性碳化合物降解的功能基因表达增强。此外，恢复过程中微生物生活史策略与碳获取方式的转变，有助于提升微生物群落的整体碳利用效率，并促进土壤有机碳的稳定与固存。基于以上结果，该研究强调了在制定喀斯特地区退化植被生态恢复相关对策时，应充分地考虑土壤微生物群落特征及其所介导的碳循环途径。

土壤-气候格局影响下的热带雨林土壤水分动态和水分入渗

结果表明：与平地、陡坡生境相比，由于山地缓坡生境土壤的丰富植物根系、土壤有机质含量、较优土壤物理特性，其维持着较高、较稳定的土壤湿度；土壤物理特性（容重、毛管持水等）对土壤湿度的影响在年水平上均为显著，其中沙粒含量的影响仅在干季比较显著，而土壤有机质和植物细根的影响在干季、雨季均较为显著；人工模拟降雨的实验表明，由于山地缓坡土壤具有的水分侧流、优先流、一致性的土壤水分流，其水分入渗方式均比平地、陡坡生境的土壤入渗方式平稳，具有较强的土壤水分维持能力；线性混合模型的模拟表明，山坡的坡度和降雨格局的交互作用显著影响着土壤水分的入渗方式和运移形式。基于以上结果，该研究进一步强调了在热带地区的森林管理、恢复和保护过程中需注重山地地形不同坡位的重要性，其中山地缓坡位应是森林生态系统的优先恢复区。

大则不同：基因组扩张有助于植物适应热带环境

结果表明，蔊菜基因组大小存在连续的种内自然变异，且与地理分布、气候梯度和谱系历史等显著相关：相较于北方温带谱系，热带谱系普遍拥有更大的基因组。基因组重复序列量化分析揭示，上述差异主要由45S rDNA和Ty1反转录转座子等特定重复序列的扩增所驱动。同质园实验将不同基因组大小的株系分别移植至西双版纳（热带）和昆明（温带），结果显示：在温度稳定的热带环境中，大基因组株系结实量更高，适应优势显著。

气温和饱和水汽压差在植被生态系统生产力中扮演的角色

研究结果表明，VPD对植被生产力表现出显著的负效应（尤其在干旱和半干旱地区），而气温在排除交互作用后总体呈现正效应，但当高温与高VPD协同发生时，气温的正向效应会被显著削弱；基于CMIP6多模式集合的预测进一步显示，未来VPD的负面效应将持续增强，气温的正效应将逐渐减弱，这种变化在中纬度地区表现最为显著。该研究不仅系统揭示了VPD在调控陆地生态系统功能中的关键作用，为理解气候变化下植被响应机制提供了新的理论依据，更重要的是发现了温度-VPD协同效应机制，这一创新发现既为解释植被生产力响应区域差异提供了新视角，也为未来生态系统管理、碳循环预测及植被适应策略制定提供了重要科学参考。

夹竹桃科植物系统发育框架与多样性演化历史研究取得新进展

系统发育分析结果显示大多数节点都获得较高的支持率，3个亚科（马利筋亚科 Asclepiadoideae、鲫鱼藤亚科Secamonoideae、杠柳亚科 Periplocoideae）被强烈支持为单系群（BS=100，PP=1.00），其中马利筋亚科与鲫鱼藤亚科构成姐妹群，杠柳亚科嵌入在Apocynoid类群中，与Endress等（2019）的分类系统一致.

热带地区附生维管植物的氮同位素分馏：氮限制实证及驱动因素

结果表明：1）附生维管植物叶-根间15N分馏效应（+0.43‰）较小，与地生植物（2‰）相比，反映了森林冠层比地面生境存在更严重的N限制；2）附生植物的叶-根15N分馏在不同分组间保持相对一致，但具有显著的物种特异性，且与系统发育无显著相关，反映了外部N源及其N获取策略的综合影响；3）附生植物的叶-根15N正分馏主要与叶片N、根C相关，而负分馏与叶片δ13C相关，暗示不同因素（如外部氮源、水分亏缺和氮获取策略）驱动着其体内15N分馏过程。

鸟类-植物互作网络的系统发育效应取得新进展

研究发现，互作伙伴数量的系统发育信号在鸟类和植物中均较弱，表明互作伙伴数量更多受其他因素（如表型特征）驱动。然而，在互作伙伴的物种组成及系统发育组成方面，系统发育信号存在较大差异。其中，系统发育距离相近的鸟类（尤其是食果鸟类）倾向于与具有相似物种组成和系统发育组成的植物互作，而这一模式在植物中并不明显。研究还发现，系统发育专性的食果鸟类往往也是互作专性物种，即它们倾向于与少数系统发育距离更近的植物物种互作。这种模式在传粉鸟类以及结果植物和开花植物中均未观察到，揭示了不同互作系统中生态专化策略的差异。

空气eDNA揭示果实资源对食果动物分布的影响

布起着重要的驱动作用。相比之下，食肉动物的分布与果实资源并无明显关联。 这一发现不仅为“食物资源驱动物种分布”的经典生态学假说提供了新的实证支持，也展示了空气eDNA在揭示生态过程方面的巨大潜力。以往的动植物关系研究大多依赖长期野外观测，往往耗时费力，且受制于样本规模和物种覆盖范围的局限。而空气eDNA技术则能够在短时间内、跨大范围同时捕捉多类群动物的分布信息，有效突破了传统方法的限制。该研究表明，空气eDNA不仅是一种高效的生物多样性监测工具，更能捕捉动植物互作的精细格局，为深入理解生态过程和生态系统运作机制开辟了全新途径。

DNA条形码揭示中国梧桐属植物隐存多样性，为其提供“分子身份证”

研究取得三项重要发现：一是明确核核糖体内转录间隔区（nrITS）为梧桐属物种鉴定的“最优条形码”，其物种鉴定率高达91.7%（11/12类群），可精准鉴定所有10个中国已知分布的梧桐属物种，解决了长期以来该属物种形态鉴别困难的问题；二是在极小种群物种“云南梧桐（F. major）”中发现2个隐存谱系（Firmiana sp.1 和 Firmiana sp.2），其中Firmiana sp.1为高达10米的栽培乔木（主要分布于云南中部古寺庙及植物园），Firmiana sp.2为分布于金沙江中下游的灌丛或小乔木，二者在遗传距离、地理分布及生长习性上均与典型的云南梧桐（位于金沙江上游）存在显著差异，提示需重新界定云南梧桐的物种边界；三是通过整合分析GenBank 数据库中48条梧桐属叶绿体基因组数据，发现2个样本被错误标定的案例，强调了DNA条形码在检验网络数据库中数据准确性的重要性。

云南省发现三种黄檀属中国新记录

尽管黄檀属是一个自然的类群，但由于种间形态差异细微、乔木类群标本不足等原因，其种间分类一直存在诸多困难，有待进一步的调查研究。该研究提供了详细的形态描述，提炼出了稳定、可靠的鉴别特征，并重新编写了我国黄檀组的物种分类检索表，增加了我国黄檀属的新成员。

城市扩张过程中生态与经济效益的多尺度权衡与协同

鉴于此，该研究建议，城市可持续发展须采取统筹的顶层规划与设计，采取因地制宜的差异化策略。例如，在产业和人口密集区，优先推进绿色基础设施建设，增加生态绿色空间，推动多功能社区建设，恢复并提升生态系统服务功能；在自然植被良好区域，继续加强森林和草地的抚育和提质增效，探索因地制宜的生态产品价值实现创新机制，实现生态保护与经济发展的双赢。同时，区域规划应结合多层级治理机制，通过区域政策与地方实践的有机结合与试点，促进经济效益与生态效益的协同发展。

PD封面|一场由东亚夏季风主导的进化：黄杞属基因组的适应密码

基因家族富集分析进一步揭示了常绿与落叶类群在功能上的显著分化。常绿类群扩张的基因主要富集于光合作用、激素信号转导及氧化还原过程等路径，反映其对湿润、低光、高竞争环境的长期适应；而落叶类群中扩张的基因则显著富集于ABA信号通路、次生代谢和防御反应相关路径，强化了其对干旱胁迫的快速响应机制。该结果表明常绿与落叶生态策略的形成不仅体现在谱系分化与基因组结构上，也深刻嵌入于基因功能的选择性扩增之中。进一步分析发现，常绿物种E. fenzelii在基因组功能上展现出显著的适应性优势。

中南半岛与马来群岛植物分布格局成因研究取得新进展

结果显示：（1）轮叶三棱栎起源于北巽他古陆，并在渐新世-中新世期间逐渐扩散至中国云南和海南，以及马来群岛的其他区域。（2）由于巽他古陆海侵海退影响，马来群岛群体经历了严重的历史瓶颈造成了长期低遗传多样性;相比之下，中南半岛的地形异质性和居群间的基因流维持了居群高遗传多样性。（3）自末次盛冰期以来，婆罗洲始终具备适宜轮叶三棱栎生存的环境条件，预计在未来气候变化背景下仍将继续发挥“避难所”的作用，为维持物种进化潜力的长期避难所应注意优先保护。该研究阐明了古地理过程和环境因素如何共同塑造了东南亚当前的植物分布格局，并通过物种水平的种群历史为理解区域生物地理动态提供了一个案例研究

杀菌剂揭示植物微生物互作的生态效应

分析表明，使用杀菌剂显著提高了原生植物物种的存活率，并增加了群落整体生物量；但与此同时，它会导致植物群落多样性下降——这种效应与排除脊椎草食动物时观察到的结果相似。出乎意料的是，尽管存活率和群落生产力明显提升，但杀菌剂对植物生长并未产生显著的整体影响。杀菌剂对植物生长效果的巨大差异，很可能源于不同植物物种积累病原真菌和有益真菌（如菌根）的程度存在差异。此外，商用杀菌剂针对不同真菌类群的特异性各不相同，这也可能影响实验结果。尽管样本量有限，但外来物种对杀菌剂的反应较弱，这与"这些植物受本地真菌病原体压力较小"的假设相一致。研究结果并未支持纬度生物相互作用假说（LBIH）。总体而言，这项研究强调了真菌病原体在维持自然植物群落多样性方面的重要作用。使用杀菌剂后观察到的个体存活率和群落生物量提升表明，平均而言病原真菌对植物的抑制作用远超共生真菌带来的益处。

JSE封面|东亚亚热带常绿阔叶林的演化

尽管目前对东亚亚热带常绿阔叶林优势树种已有较多研究，但伴生树种和草本植物的动态变化同样值得关注，这将有助于全面揭示东亚亚热带常绿阔叶林的生态系统演变规律。该综述整合了当前东亚亚热带常绿阔叶林演化研究的前沿认知，并提出应对人类世背景下的挑战和研究建议。

叶片泡状细胞驱动叶片快速卷曲调控竹类植物的水分平衡

该研究首次揭示泡状细胞结构与叶片保水能力在竹类植物干旱响应过程中的协同作用，为竹类抗旱育种提供了研究靶点。未来需进一步探索泡状细胞形态变化与水分运输的分子机制，以更精准预测气候变化下竹类生态系统的韧性。

植物水力特性差异驱动树干液流方法对于植物蒸腾估算的准确性

结果表明，（1）多数物种的重新校准模型参数与Granier经典参数显著不同，尤其是高导水性的环孔材与藤本，其蒸腾低估程度尤为突出。（2）不同的统计模型、参数校准过程中所施加最大压力等对于矫正的模型参数具有不同程度影响。值得注意的是，植物的水力特性，例如木质部比导率，木质部导管腔面积占比对于种内和种间模型参数的变异具有较高的解释率，木质部比导率对于两项参数的解释率分别达到了90%和79%，这为未知物种模型参数的快速估算提供了可靠依据，将大大减少繁琐的参数校正工作。（3）为验证上述结论，研究团队将重新校准参数与Granier经典模型应用于橡胶种植园蒸腾量估算，全面评估了不同影响因素及其权重。结果显示，Granier模型严重低估林分蒸腾量，而新校准参数估算结果更为合理。此外，树液边材面积及径向变化、方位等尺度的非生理因素对蒸腾估算具有显著影响。