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版纳植物园樟科植物叶绿体比较基因组学研究再获进展

时间:2017-10-30  来源:科技外事处  浏览次数:   作者:宋钰     打印  字体: 关闭

  楠木是中国传统的名贵木材之一,主要来源于樟科润楠-鳄梨属群树种。然而,这一属群各属内部的种间关系尚不明晰。继润楠属和鳄梨属叶绿体基因组研究的报道之后,版纳植物园生物多样性研究组研究人员以分布于我国南部地区的紫楠(Phoebe sheareri (Hemsl.) Gamble)和四川盆地的峨眉楠(Phoebe omeiensis R.H. Miao)为实验材料,通过长链PCR和二代测序技术完成了叶绿体基因组进行全覆盖测序。通过比对发现,樟科楠属植物的叶绿体基因组大小约为153 kb,与近缘属润楠属(Song et al. 2015, Frontiers in Plant Science, 6: 662)和鳄梨属(Song et al. 2016, Canadian Journal of Forest Research, 46: 1293)植物相似;两个楠木叶绿体基因组共有222个突变位点,包括146次替换事件、73次插入缺失事件和3次小倒位事件;突变位点在叶绿体基因组上呈现非随机性分布,共有38个聚集区。基于该研究结果,研究人员对楠属植物叶绿体基因组的基因和结构进行比较,定位突变位点,并利用高变区域构建进化树,明确了十二种国产楠属植物的亲缘关系。研究结果再次证实了樟科植物叶绿体基因组也存在种间遗传差异小的事实,明确了樟科植物叶绿体基因组的高聚集区序列与传统分析序列不同,并初步划定了国产楠属植物的四个主要分组。 

        该成果以Comparative analysis of complete chloroplast genome sequences of two subtropical trees, Phoebe sheareri and Phoebe omeiensis (Lauraceae) 为题在线发表于国际学术期刊Tree Genetics & Genomes。该研究得到了国家自然科学基金委(31600531),中国科学院“西部之光”(Y7XB061B01)项目的资助。

楠属植物叶绿体基因组

紫楠(Phoebe sheareri (Hemsl.) Gamble)和峨眉楠(Phoebe omeiensis R.H. Miao

 

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